Asteraceae
familyasına ait Centaurea L.
cinsi sistematik açıdan tartışmaları barındıran ve son yıllarda gelişen
moleküler tekniklerin ışığında taksonomik problemleri aydınlatılması gereken
bir cinstir. Özellikle Centaurea depressa
türünün taksonomik konumu tartışmalı olup bazı araştırmacılar tarafından Cyanus cinsinde olması gerektiği iddia
edilmiştir. Bu problemi açığa kavuşturmak için, cinse ait beş türün (C. depressa, C. iberica, C. solstitialis, C.
virgata, C. balsamita) filogenetik ilişkileri kloroplast DNA’sında bulunan
ve filogenetik çalışmalarda tercih edilen trnT(UGU) - trnL(UAA)
IGS, trnL5’- trnL3’ intron ve trnL(UAA) - trnF(GAA) IGS
bölgeleri kullanılarak belirlenmeye
çalışılmıştır. Cinse ait bazı türlerin
DNA sekansları NCBI veri tabanından alınarak analizlere eklenmiş ve hem C.
depressa’nın hem de çalışılan diğer dört türün cins içindeki evrimsel
ilişkileri aydınlatılmaya çalışılmıştır. Maksimum Olasılık (ML) ve Maksimum
Parsimoni (MP) metodlarıyla filogenetik ağaçlar oluşturulmuştur. trnT(UGU) - trnL(UAA) ve
trnL5’- trnL3’ intron
bölgeleri için oluşturulan ağaçlarda C.
depressa türü diğer akraba türlerden filogenetik olarak ayrılmamıştır. trnL(UAA)
- trnF(GAA) IGS bölgesinde yeterli kalitede sekanslar elde
edilemediğinden çalışmamızda bu bölge detaylandırılmamıştır.
The
genus Centaurea L., belonging to
Asteraceae family, contains systematic controversies and these taxonomic
problems must be illuminated in the light of the molecular techniques developed
in recent years. Especially, taxonomic position of Centaurea depressa is controversial and moving of this species
to Cyanus genus is claimed by several
researchers. To solve this problem, phylogenetic relationships of five
species (C. depressa, C. iberica, C. solstitialis, C. virgata, C. balsamita)
were tried to be determined by using the trnT(UGU) - trnL(UAA), trnL5’- trnL3’ intron and
trnL(UAA) -
trnF(GAA) IGS regions which are found in the
chloroplast DNA and are preferred for phylogenetic studies. DNA sequences of
other species belonging to the genus Centaurea
were retrieved from NCBI database and analyzed to clarify the evolutionary
relationships of not only C.
depressa but also the other four species. Phylogenetic trees were
constructed by using Maximum Likelihood (ML) and Maksimum Parsimony (MP) methods. That’s
why, the data obtained from the trnL-trnF region will not be shared. Centaurea depressa is not phylogenetically separated from other
related species in the trees contructed by using trnT(UGU) - trnL(UAA)
and trnL5’-
trnL3’ intron regions. DNA sequences obtained from trnL(UAA) - trnF(GAA)
IGS region are not clear so this region is not elaborated.
Journal Section | Natural Sciences |
---|---|
Authors | |
Publication Date | December 8, 2017 |
Submission Date | May 17, 2017 |
Acceptance Date | November 21, 2017 |
Published in Issue | Year 2017 |